为实现项目管理办公室（PMO）短期和长期的工作目标、工作范围和工作内容，使工作流程程序化，加强工作功能，使其持续运行，可以PMO设置过程分为以下四个阶段

第一阶段：确定PMO的短长期目标和工作范围及内容
首先通过调查分析，确定组织项目管理成熟度，并了解员工对组织的期望；对组织及现有的项目进行SWOT分析，明确组织现状和愿景规划，建立PMO短期和长期目标
PMO确定组织结构PMO职能和人员

第二阶段：按PMO实施发展计划，不断完善计划
PMO不断修改短期计划，有助于完善长期计划
建立适合组织的管理标准体系，制定和实施培训计划，提供项目指导
PMO现阶段必须能够步入正规，为组织项目管理体系提供实施前景，为第三阶段的工作提供条件

第三阶段：健全PMO本阶段的主要工作是在第二阶段的基础上继续实施PMO计划.健全PMO的职能，令PMO研发成果直接给组织带来好处
研发成果包括培训计划的实施过程、管理体系的运行、阶段报告分析、阶段报告程序、项目数据管理体系、项目管理软件、工具、技术、手段的开发和参考

第四阶段：强化PMO工作功能，并使其持续运行
这一阶段的工作是继续加强PMO 的工作职能不断提高PMO工作方式，并扩大其工作范围，优化项目管理活动，并在各种持续的工作中提供指导，为组织提供各种支持